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1、蛋白质的种类繁多，结构复杂，迄今为止没有一个理想的分类方法。
2、着眼的侧面不同，分类也就不同，例如从蛋白质形状上，可将它们分为球状蛋白质及纤维状蛋白质；从组成上可分为单纯蛋白质(分子中只含氨基酸残基)及结合蛋白质(分子中除氨基酸外还有非氨基酸物质，后者称辅基)；单纯蛋白质又可根据理化性质及来源分为清蛋白(又名白蛋白，albumin)、球蛋白(globulin)、谷蛋白(glutelin)、醇溶谷蛋白(prolamine)、精蛋白(protamine)、组蛋白(histone)、硬蛋白(scleroprotein)等。
3、结合蛋白又可按其辅基的不同分为核蛋白(nucleoprotein)、磷蛋白(phosphoprotein)、金属蛋白(metalloprotein)、色蛋白(chromoprotein)等。
4、此外，还可以按蛋白质的功能将其分为活性蛋白质(如酶、激素蛋白质、运输和贮存蛋白质、运动蛋白质、受体蛋白质、膜蛋白质等)和非活性蛋白质(如胶原、角蛋白等)两大类。
5、一、简单蛋白的分类 1. 清蛋白(又名白蛋白，albumin)：溶于水、稀碱及稀酸溶液，为饱和硫酸铵所沉淀，广泛存在于生物体内，如血清清蛋白、乳清清蛋白等。
6、2. 球蛋白(globulin)：为半饱和硫酸铵所沉淀，不溶于水而溶于稀盐溶液的称优球蛋白(euglobulin)；溶于水的称拟球蛋白(pseuglobulin)；普遍存在于生物体内，如血清球蛋白、肌球蛋白和植物种子球蛋白等。
7、3. 谷蛋白(glutelin)：不溶于水、醇及中性盐溶液，但易溶于稀碱或稀酸，如米谷蛋白（oryzenin）和麦谷蛋白(glutelin)等。
8、4. 醇溶谷蛋白(prolamine)：不溶于水及无水乙醇，但溶于70%-80%乙醇中，组成上的特点是脯氨酸和酰胺较多，非极性侧链原较极性侧链多，主要存在于植物种子中，如玉米醇溶谷蛋白（zein）、麦醇溶谷蛋白（gliadin）等。
9、5. 组蛋白(histone)：溶于水及稀酸，但为稀氨水所沉淀，分子中组氨酸、赖氨酸较多，分子呈碱性，如小牛胸腺组蛋白等。
10、6. 精蛋白(protamine)：溶于水及稀酸，但溶于氨水，分子中碱性氨基酸特别多，因此呈碱性，如鲑精蛋白（salmin）等。
11、7. 硬蛋白(scleroprotein)：不溶于水、稀碱及稀酸溶液，这类蛋白是动物体内作为结缔及保护功能的蛋白质，如角蛋白（keratin）、胶原（collagen）、网硬蛋白（reticullin）和弹性蛋白（elastin）等二、结合蛋白质的分类 1. 核蛋白(nucleoprotein)：辅基是核酸，如脱氧核糖核蛋白、核糖体、烟草花叶病毒等。
12、2. 脂蛋白（lipoprotein）：与脂结合的蛋白质，脂质成分有磷脂、固醇和中性脂等，如血中的各类脂蛋白、卵黄球蛋白（lipovitellin）等。
13、3. 糖蛋白（glycoprotein）和粘蛋白（mucoprotein）：辅基成分为半乳糖、甘露糖、己糖胺、己糖醛酸、唾液酸、硫酸或磷酸等，如卵清蛋白等。
14、4. 磷蛋白(phosphoprotein)：磷酸基通过脂键与蛋白质中的丝氨酸或苏氨酸残基相连，如酪蛋白、胃蛋白酶等。
15、5. 金属蛋白(metalloprotein)：辅基为血红素，它是卟啉化合物，卟啉环中心含有金属，含铁的如血红蛋白，含镁的如叶绿素，含铜的有血蓝蛋白等。
16、6.黄素蛋白（flavoprotein）：辅基是黄素腺嘌呤二核苷酸，如琥珀酸脱氢酶、D—氨基酸氧化酶等。
17、7. 金属蛋白（metalloprotein）：与金属直接结合的蛋白质，如铁蛋白含铁，乙醇脱氢酶含锌，黄嘌呤氧化酶含钼和铁等。
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